Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gp49aQ61450 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gp49aQ61450 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms