Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Foxg1Q60987 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms