Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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DbpQ60925 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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DbpQ60925 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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DbpQ60925 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
DbpQ60925 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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DbpQ60925 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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DbpQ60925 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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DbpQ60925 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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DbpQ60925 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
DbpQ60925 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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