Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mkrn3Q60764 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Mkrn3Q60764 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mkrn3Q60764 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mkrn3Q60764 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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