Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Psme4Q5SSW2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms