Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms