Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r223Q5SSA0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms