Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms