Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnpc3Q3UZ01 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnpc3Q3UZ01 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.8 ms