Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm28047Q3US59 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28047Q3US59 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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