Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem253Q3UNB8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms