Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Parp8Q3UD82 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms