Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ssbp4Q3U4B1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ssbp4Q3U4B1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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