Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc10Q3TLI0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc10Q3TLI0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms