Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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