Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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