Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ptcd3Q14C51 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ptcd3Q14C51 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ptcd3Q14C51 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ptcd3Q14C51 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ptcd3Q14C51 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms