Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms