Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms