Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc162pQ0VG85 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc162pQ0VG85 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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