Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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