Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms