Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Itgb8Q0VBD0 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Itgb8Q0VBD0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Itgb8Q0VBD0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Itgb8Q0VBD0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms