Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms