Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Siah2Q06986 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms