Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdk18Q04899 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdk18Q04899 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms