Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms