Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scg2Q03517 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms