Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gjb4Q02738 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms