Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ascl1Q02067 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms