Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Atp9bP98195 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp9bP98195 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp9bP98195 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp9bP98195 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp9bP98195 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp9bP98195 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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