Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pitx2P97474 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms