Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psme1P97371 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1528.1 ms