Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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