Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf1P81269 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms