Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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