Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Hoxd13P70217 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxd13P70217 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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