Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps3P62908 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps3P62908 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms