Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gabra1P62812 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms