Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms