Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab8bP61028 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms