Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CdaP56389 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CdaP56389 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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