Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Sh3bp1P55194 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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