Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tlx1P43345 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms