Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtbP41155 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtbP41155 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms