Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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