Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtlP38585 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtlP38585 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms