Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms