Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RxraP28700 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RxraP28700 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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