Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DcnP28654 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DcnP28654 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DcnP28654 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DcnP28654 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DcnP28654 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DcnP28654 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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DcnP28654 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DcnP28654 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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